Prefinanţarea în cadrul proiectelor finanţate cu fonduri structurale va avea o cotă de maxim 10% din valoarea eligibilă a proiectului, iar alocarea se va face în cel puţin două tranşe, cu excepţia proiectelor majore, pentru care cota de prefinanţare poate fi de maxim 20%, ca urmare a publicării Ordinului Ministerului Finanţelor Publice de modificare a Normelor de aplicare a OUG nr. 64/2009.
Excepţia de la această măsură este dată de proiectele pentru care contractele / deciziile / ordinele de finanţare prevăd depunerea a cel mult două cereri de rambursare, prefinanţarea putându-se acorda într-o singură tranşă. De asemenea, prefinanţarea se poate acorda într-o singură tranşă, în cotă de maxim 35% din valoarea totală a finanţării, în cazul proiectelor care intră sub incidenţa ajutorului de stat / de minimis, se arată în Ordinul MFP.
De asemenea, prima tranşă de prefinanţare se acordă în cotă de maxim 5% din valaorea eligibilă a proiectului, iar următoarele tranşe pot fi acordate numai după autorizarea cheltuielilor efectuate, în valoare de minim 60% din valoarea cumulată a tranşelor anterioare de prefinanţare.
Autorităţile de management au obligaţia recuperării prefinanţării prin stabilirea în contractele / deciziile / ordinele de finanţare a unui procent de deducere a prefinanţării de minim 30%, aplicat la valoarea fiecărei cereri de rambursare transmise de beneficiar, cu excepţia cererii de rambursare în cadrul căreia cuantumul prefinanţării rămase de recuperat reprezintă mai puţin de 30% din aceasta şi cu excepţia ultimei cereri de rambursare.
În plus, autorităţile de management au obligaţia recuperării integrale a prefinanţării acordate în cazul proiectelor pentru care beneficiarii nu transmit nicio cerere de rambursare în termne de maxim 4 luni de la primirea acesteia. În cazul proiectelor pentru care beneficiarii nu transmit, în termen de 6 luni de la primirea primei tranşe de prefinanţare, cereri de rambursare în cuantum de minim 20% din valoarea prefinanţării acordate, autorităţile de management au obligaţia recuperării prefinanţării neutilizate pentru efectuarea cheltuielilor eligibile incluse în cererile de rambursare primite, se arată în acelaşi document.